奶樣品用特制的緩沖溶液來進行處理，使其內的體細胞被熒光染料染色。這些溶液被注入到流式細胞儀內，通過水壓聚集起來，確保被染色的體細胞能夠截斷一股激光強束，使體細胞發出熒光。然后，這些熒光被收集起來并檢測。在整個體細胞計數結果中，以柱狀分析圖來顯示電子脈沖的高度和寬度。這些柱狀圖被記錄并歸檔保存起來，以便將來能再把它們調取出來，使得增強數據分析方法成為可能。
　　
　　牛奶體細胞分析儀的工作原理：
　　
　　基于藥劑水溶液和牛奶中體細胞的相互作用，導致牛奶粘稠度變化。體細胞越高，牛奶的粘度就變得越高。
　　
　　設備通過計算牛奶混合物流經毛細管的時間，就可以在設備屏幕上顯示出牛奶中體細胞數量（流經時間也會同時顯示,通過大量數據測試儲存）。
　　
　　牛奶體細胞分析儀注意事項：
　　
　　1、奶樣應為8小時內擠出的鮮奶，凍藏奶樣需恢復至室溫；
　　
　　2、測試前勿將試紙沾濕；
　　
　　3、勿彎曲或拆開試紙組件、觸碰圓孔，避免圓孔內接觸細碎污垢；
　　
　　4、避免陽光直射或溫度；
　　
　　5、環境溫度在7℃到35℃之間測試效果*；
　　
　　6、測試奶樣不能摻有防腐劑之類的東西，如布羅波爾等；
　　
　　7、激活劑為化學藥品，請勿飲用；
　　
　　8、滴管可重復使用，*擠盡上次剩余奶液，在第二個奶樣或是清水中反復擠捏3-4次；
　　
　　9、試紙、激活劑、比色卡要在2℃～25℃下避光干燥保存。
　　
　　10、包裝拆開后盡量在4小時內使用。
　　
　　應用領域：
　　
　　1）牛奶體細胞分析儀可用于活細胞測試、體液計數和體細胞計數。它可用于計算細胞總數、非活細胞和體液、DNA熒光染色劑（PI或EtBr）染色。該儀器采用UV可見光源來計數RBC；
　　
　　2）可用于HACCP管理；判定體細胞等級；保證乳制品業的競爭力；
　　
　　3）原汁鮮奶從農場奶罐送到運奶車中預先檢測；
　　
　　4）可測定不同奶牛的每個乳房的體細胞。